高端光纖磁盤陣列(如EMC2的Symmetrix、日立的HDS高端磁盤陣列)采用的結構類似，但一般都有各自的獨特之處。比如EMC2的DMX結構、HDS的Hi-Star switched architecture結構都是為高端磁盤陣列而設計的，可以提供更高的性能、可靠性、可用性、可擴展性、及更多的高級功能--如對業務連續性的支持。
從光纖磁盤陣列的結構可以看出首先它的最為突出的優勢是存儲共享。與其他陣列（如SCSI陣列）不同，光纖磁盤陣列可以接入存儲區域網，多臺主機可以通過存儲區域網同時訪問一臺或多臺光纖磁盤陣列。這就為存儲集中和共享提供了最為靈活的硬件和網絡平臺。
其次光纖磁盤陣列的另一個優勢是其高可用性。光纖磁盤陣列不但具有普通磁盤陣列所支持的各種高可用性功能，如對RAID的支持、Hot-Spare硬盤、RAID自動重建、后臺在線重建、在線RAID擴容、硬盤熱插拔、支持并發I/O及命令隊列、磁盤陣列配置備份、緩存電池保護、硬盤故障自動檢測等；而且雙控制器、多冗余環路、多主機接口的冗余配置，不但保證了本機的可用性，而且可以防止了存儲區域網上其他設備故障對數據存取的影響。
在存儲共享和高可用性的優勢之后才可以提到高性能的優勢。光纖通道較傳統存儲技術（如SCSI）來說，支持更高的性能。目前光纖磁盤陣列對內、對外都可以支持200MByte/s的全雙工讀寫，不久的將來1GByte/s的產品即將上市。
此外光纖磁盤陣列的另一個優勢是其高可擴展性。一方面，對于同一個磁盤陣列來說，由于其采用仲裁環結構，理論上一個環上可以接多達126塊硬盤，這相對于SCSI總線上最多15塊硬盤的容量明顯高了很多；而且還可以通過增加同一個磁盤陣列支持的環路數來增加支持的硬盤數。另一方面，在由光纖通道構成的存儲網絡中，由于光纖磁盤陣列可以被共享，當某臺主機訪問某臺陣列上安裝的硬盤達到最大而不能再擴充容量時，完全可以通過將另一個陣列上的存儲空間共享給該主機實現實際上的存儲空間的擴展。
根據光纖磁盤陣列的優勢和特點，其主要應當應用在對數據共享、高可用性/高可靠性、高性能和高擴展性要求很高的行業或環境中。對于國內廣泛應用IT的行業具體情況來說，像金融、電信、電力、稅務、化工、冶金等關鍵業務部門的數據中心采用共享磁盤陣列存儲數據是非常必要的，它可以滿足這些行業對于高可靠性/高可用性、高性能的苛刻要求；像媒體、圖書檔案館、科技研究、監聽等數據量要求非常大的行業數據中心，采用光纖磁盤陣列可以很好地滿足其大容量存儲、不斷擴展等方面的要求。
需要注意的是在選擇應用光纖磁盤陣列時，一般會選擇存儲區域網SAN作為整個IT信息系統的基本架構。在SAN架構中，由服務器或主機、光纖交換機、光纖磁盤陣列、光纖帶庫共同組成一個存儲網絡；而客戶端和其他存儲需求不大的服務器則通過常用的IP網絡與存儲網絡中的服務器通信。
此外在高端的NAS應用中，往往會采用NAS機頭(NAS head)作為NAS服務器的控制端，光纖磁盤陣列通過SAN或直連連接到NAS head上，為其提供高性能、大容量、高可用性的存儲后端。
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