然而在iSCSI這邊，其部署的簡單和低廉成本也是很誘人的優勢。而且，把服務器連接到FC網絡上需要安裝一臺昂貴的HBA及其驅動和管理程序，而連接到iSCSI網絡則只需要一塊千兆以太網卡而已。當然還需要一套iSCSI啟動程序，但這個程序在很多平臺中都是免費提供的。 
      FC的額外成本限制了其在低端的部署。在2.5萬美元以下的服務器市場上，FC的使用率不到5%。但是這種成本差距正在縮小，因為像博科、Emulex和QLogic等廠商通過降低價格、簡化管理、減少客戶定制選件等辦法已經把FC HBA和交換機引進了中小企業市場。事實上，目前一套FC HBA的預算已經和iSCSI HBA的預算相差不多了，因為現在使用后者的用戶一般都要求標準的千兆以太網聯接，還有提升性能的軟件等，這些都增加了后者的成本。 
    用戶偏愛FC的另一個重要因素是其名義傳輸率：2Gbps（很快會增加到4Gbps），而iSCSI的傳輸率只有1Gbps。這個速度差距對于端到端的連接來說意義不大，因為在此連接中，服務器和存儲設備通常都是低速連接的。然而在存儲光纖網絡中，有多臺交換機堆疊的情形中，這種速度差距的意義就很大了。  
    具有諷刺意味的是，盡管iSCSI的支持者經常宣稱能夠負擔得起的未來的萬兆以太網很快就會出現，但是直到目前為止，能夠提供10Gbps連接的低成本產品卻只有SANbox5200，是來自QLogic的FC交換機。 
    如果不考慮速率，iSCSI也肯定會在未來獲得更多的關注，因為未來的部署有可能會大量集中在較小的數據中心。
iSCSI產品的數量增長極快，像EMC和惠普，還有EqualLogic、LeftHand網絡和Sanrad都推出了很多新的解決方案。同時，像博科、思科和McDATA等交換機廠商也在大量生產iSCSI產品。  
   對很多企業來說，選擇FC還是iSCSI已經簡化成了人才的價格問題。招聘和培訓FC專業人員的費用要比獲得iSCSI專業支持的成本大得多，這是那些打算選擇SAN的用戶必須考慮的關鍵因素之一。不過這兩方面的成本目前都在減少。假如已經有了FC人才，而FC硬件的價格又肯定會下降的話，大企業就沒有理由拒絕FC這種高性能的、已相當成熟的技術。